El programa cuenta con el más completo e integral grupo de:

• Laboratorios en las ciencias de la salud y la biología.
• Laboratorios especializados en electrónica, procesos industriales, hidráulica, física, máquinas.
• Clínica Universitaria El Bosque, donde se muestran los avances médicos que han sido posibles gracias a la Bioingeniería y a la interacción coherente entre las ciencias.

Líneas de investigación

• Biónica e Ingeniería de Rehabilitación: El objetivo de esta área de investigación es la de concebir, diseñar, implementar y operar tecnologías de soporte y apoyo biológico para mejorar la calidad de vida de los seres vivos y su interacción con el medio ambiente.
• Bioinstrumentación: El objetivo de ésta área de investigación es la de concebir, diseñar, implementar y operar sistemas de adquisición de datos, con el objetivo de capturar, medir y procesar información de sistemas y procesos biológicos. La naturaleza de los datos incluye variables eléctricas, mecánicas, ópticas y físico-químicas en una dimensión, 2D (Imágenes) y 3D (escaneo de luz estructurada).
• Biosensores: El objetivo de esta área de investigación se centra en concebir, diseñar, implementar u operar sistemas de detección de variables biológicas en escala milímetros, micrómetros (MEMS) y nanómetros (NEMS), que combinan un componente biológico (e.g., tejidos, microorganismos, enzimas, receptores celulares, anticuerpos, y ácidos nucléicos) con otro componente transductor de tecnología fisicoquímica y/o óptica. La detección de variables biológicas pueden ser monitoreadas in-vivo, in-vitro, on-line, o en puntos críticos de algún proceso industrial o de salud pública.
• Bio-procesos e Ingeniería de Tejidos: El objetivo de esta área de investigación es la de concebir, diseñar, implementar y operar equipos y procesos para la manufactura de forma escalada de productos que incluyen alimentos, fármacos, suplementos nutricionales, químicos y polímeros, basados en materiales biológicos. En particular, se incluyen sistemas y procesos en los que se combinan células, ingeniería (Bioreactores), materiales, agentes bioquímicos y factores físico-químicos para mejorar o remplazar un tejido.
• Bio-informática: El objetivo de esta área de investigación es la de desarrollar y mejorar métodos para el almacenamiento, recuperación, organización y análisis de datos biológicos. Utilizar tecnología de imágenes y procesamiento de señales para la extracción de información útil en experimentos de la biología molecular. En los campos de la genética y genómica,  la bioinformática ayuda al secuenciamiento y anotación de genomas y sus respectivas mutaciones.

Los estudiantes deben llevar a cabo numerosas prácticas, salidas de campo y salidas técnicas donde ejercitan sus competencias y capacidades. Por un lado, desde su calidad humana, aportarán su ingenio a la solución de problemas de poblaciones, espacios naturales y especies en peligro; desde su profesionalismo, aportarán sus competencias a la creación de soluciones para empresas del sector productivo o del sistema de protección social.